为了这次的征虏，朱载坖是做了充分的准备的，因为朝廷不仅仅是要击败北虏，更重要的是要实际控制松花江以南，这需要大量的人口，尤其是卫所士卒，才能够且耕且屯，将这些土地给控制下来，所以朱载坖从山东、直隶、辽东、大宁等北方卫所中挑选军余子弟和舍人们，鼓励他们移民实边，对于愿意前往松花江以南的，所开垦的土地，五年起科，也就是免税五年。
同时为这些士卒们提供皮袄、胖袄等御寒的衣物，还有棉被等物资，在头三年，朝廷对于所有的卫所军士，都按照脱产军士的标准予以供应，即每人每月一元和米一石，用于这些士卒们养家糊口，在三年之后，朝廷从各卫所抽调组建脱产军士，除了这些之外，朝廷还要保障这些士卒们的种子、农具、耕牛等物资，优先挑选有家有口的军余子弟前往，这样才能够保证朝廷持续的控制这些地方。
还要发给安家费，同时运输各种物资帮助他们在松花江以南安顿下来，按照朱载坖之前和五军都督府所统计的数据，准备在松花江以南设立卫所二十个，着重控制吉林、长春、松原、白城、延吉一线，东制朝鲜，西怀蒙古，南靠辽东，北御土蛮，这就是朝廷对于这些新设立的卫所的定位。
同时将这些女真部落也要置于这些卫所的管理之下，将这些卫所编成一个新的都司，即吉林都指挥使司，同时从辽东镇调遣部分官军充实吉林都司的兵力，朱载坖的想法是在三年内向吉林都司投资五百万，沿松花江建立起大明的防线，还有修筑直道和辽东、大宁等镇相联系。
根据辽东镇的查探，现在松花江南北，土蛮部有精壮部众六万余，还有兀良哈部残部和当地的蛮夷，怎么说也是有十万之数的，朝廷不能等闲视之，而且在处理土蛮之前，朝廷要先处理朝鲜，朝鲜在大明对于辽东无力经略的时候，偷偷摸摸搞了不少的事情，之前大明没工夫搭理他，现在朱载坖自然是要和朝鲜算算总账了。
朱载坖通过驻朝大臣，还有王兀堂等女真部落的控诉，大概得知了朝鲜这百余年来所干的好事，自李成桂起，朝鲜即以恢复高句丽旧疆为夙愿，为此在两江流域
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