监和幸臣也都受到了清算了，杨廷和将武宗的势力一网打尽，为嘉靖上位扫平了障碍。
当然，杨廷和在这时节展示的手腕与魄力，让嘉靖深深的忌惮。
杨廷和根据遗诏命太监张永、武定侯郭勋、安边伯许泰、尚书王宪挑选各营兵马，分布在皇城的四门、京城的九门及南北要害地带，厂、卫御史安排他们的部下四处巡逻防备。
又传达武宗遗令，裁汰威武营的各团练部队；周边部队入卫京师的都给以重赏，然后各归本镇；废除皇家商店和军门办事官校，原办事人员全部遣回家乡所在的卫所；哈密、吐鲁番、佛郎机各国进贡使臣都给以奖励，送他们回国；豹房的番僧及少林僧、教坊的乐队、南京的快马船等，凡不是经常例设置的，一切都被裁撤、解散。又按照武宗遗诏，释放南京被逮捕、关押的囚犯；送回各地进献的女子；停止京城里不急需的工程建设；收回了宣府行宫中的金银宝贝，放回到内库中。
嘉靖怎么会不知道，所谓武宗遗命，都是杨廷和的意思罢了。后来虽然杨廷和父子因为大礼议与嘉靖闹翻，甚至闹出了左顺门之变，但是嘉靖只是流放了杨慎，让杨廷和致仕罢了。但是等到嘉靖八年，杨廷和去世。
此时的嘉靖已经坐稳了皇位，对杨廷和就不再客气了，首先是嘉靖七年（1528年），《明伦大典》修成，世宗重定议礼诸臣之罪，杨廷和被定为罪魁。世宗降敕称杨廷和“为罪之魁，以定策国老自居，（以）门生天子视朕”，将其削职为民。
嘉靖八年（1529年）五月，杨恒去世，杨廷和哀痛过度。六月二十一日（7月25日），杨廷和在新都“端坐而逝”，享年七十一岁。以庶民礼下葬新都城西父亲杨春墓旁。一代权相就此落幕。
杨廷和对嘉靖的阴影实在是太大，导致嘉靖对阁臣的防范十分之严厉。之前夏言为何被杀？他与曾铣图谋复套只不过是个诱因，嘉靖对他早就不满，只不过借此爆发出来了而已。
夏言为相，专横跋扈，不容许任何人跟他作对，夏言重回相位后，一心排除异己，被他罢官、治罪的多达十余人，其中包括唐龙、王暐、王用宾、何鳌等，引起嘉靖的不满。
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