这是朱载坖和张居正之间最大的分歧，张居正认为，为了尽可能保证朝廷的货币收入，要尽可能的实行大规模的折色，这样方便朝廷财政的征收和支给，但是朱载坖则是一直反对全面折银的办法。
为此，君臣两人曾经多次深入讨论此事，张居正认为将所有的赋役全部折银，可以简化朝廷征收和解运赋税的程序，也使得百姓能够减轻一些负担，但是朱载坖认为，此事不能够搞一刀切，必须要保证朝廷又足够的本色收入。
朱载坖认为，对于朝廷来说，本色收入的有着重要的意思，一是作为朝廷的储备，用以应对各种天灾人祸，赈济百姓，平抑物价，二就是作为朝廷的物资保障，这些本色收入也是军储的重要来源，是朝廷保障官军军需和军事行动所必须的，所以朱载坖认为田赋作为朝廷的正项钱粮，是不能够折色的。
朱载坖就是要本色上缴的这些粮食，充实朝廷的库藏，各处官军的军储，以备不时之需，同时，利用不折色的田赋，使得东南地区始终保持着一定比例的粮食播种面积，使得东南至少能够养活自己。
朱载坖很清楚，一旦全部折色之后，百姓为了追求更高的经济利益，肯定是会放弃种植粮食而选择重视收益更高的棉花等经济作物，这就是使得东南的粮食产量进一步减少，而东南都是大明人口最稠密的地方，而且也拥有大明数量最庞大的城市工人群体，这些人对于物价是很敏感，一旦物价尤其是粮价出现巨大的波动时，对于他们的影响将会是很明显的，一旦出现粮食危机，而朝廷又不能迅速的调集物资，平抑粮价的话，民变将会迅速发生。
这是朱载坖最担心的情况，所以朱载坖一直不希望全面折色也就是这个原因，虽然随着经济的发展，朱载坖也很清楚，东南不可能还是大明的粮仓，随着东南人口的进一步增加，还有大规模种植棉花等经济作物的影响，东南的粮食产量肯定会下降的，现在东南就已经要依靠湖广的粮食来缴纳漕粮了。
但是朱载坖仍旧希望东南拥有基本粮食生产能力，至少能够在正常情况下自给自足，同时即便是遇到一些天灾，也能够依靠朝廷建立的各种仓
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