瘴疠去处，止令土军在彼守堡，土军盖练习风土，其余守堡官军移散于无瘴地面，或出或入，权蹔屯驻，侯瘴疠清时，仍令各还原堡，其来降大头目，仍以好屋宇居其家小，令其子侄亲人看家，遣之来朝。”
同时命令转运药物给军前，但是瘴疠已经在军中流行起来了，军中瘴疠大作，据英国公张辅的奏报：“今瘴疠大发，军士病且甚，一旗有一二十名者有之，有二三十名者有之。”当时官军一旗，满编不过五十人，可见这个时候瘴疠的厉害程度，已经严重影响了官军的战斗力。
成祖为此极为揪心，严厉斥责张辅、沐晟等人，成祖皇帝在上谕说道：“朕闻有瘴，则促使班师，及奏无瘴，则唯令留镇，朕之此心，无非欲为军士之便。今瘴疠如此，尔等乃坐视不顾，惟事饮酒，忿争私气，又不预为奏闻，兼往来之人，相传不一，不知尔等用心何为？从征将士，远离父母妻子，跋涉山川，劳动筋骨，勤苦至甚，方今夏熟，即拣高爽之地，以休息之，养威畜锐。今天气炎暑，鸡翎、坡垒等处皆有瘴疠，尔等不用心计较，又不奏来，往往差人至中途，间多染瘴疠成疾，一二十人之中止有一二人得达者，然亦因病不支。凡有所问，皆昏愦不能荅，应致人如此，尔等何不仁之甚，今后果系紧要事务，不可缓者，则差人来，如非紧急重事，可以缓者，姑俟秋凉，途中瘴疠稍清，却一一奏来！”