在大明的整个官僚系统，所以必须控制此案的波及范围，朱载坖的目的是在豪商和官僚之间制造不信任，不是要掀起大规模的刑狱，这点朱载坖还是很清楚的。
所以在朱载坖要和朱翊釴两人紧密配合，当然了，申时行等人的助力也是很重要的，这点朱载坖已经和申时行交代过了，在朱载坖明确拒绝将本案交由三法司处理之后，内阁辅臣和部院重臣在文渊阁商量此事，大家都很清楚，朱载坖已经开始动手了，这是他们都早有准备的。
这些人给朱载坖制造了这么大的麻烦，朱载坖要是毫无反应的话，那就不是朱载坖的性格了，但是重臣们担心的是此案一旦发酵，波及面太大，将会影响到朝廷的稳定，这点是很明确的，他们不在乎朱载坖抓人或者是抄家，但是重臣们关心的事朝廷的平稳，这点很重要。
申时行提议，此事还是得向太子陈情，朱翊釴毕竟是太子，很多时候朱载坖还是要听的，所以最好的办法就是通过朱翊釴去说服朱载坖，保证此案不能太过于扩大，形成类似于空印、郭桓两案的大案。