，克讹迹邗、马都等城。嘉靖十年，萨亦德以“圣战”名义向西南方向进行扩张战争，吞并了克什米尔、拉达克等地。次年，遣部将领兵攻打佛教圣地拉萨。嘉靖十二年，萨亦德汗病死于南征途中。其子阿不都·拉失德嗣位。满速儿闻讯后，即刻发兵西征，企图趁机吞并其弟辖地，但以失败告终。嘉靖二十三年，满速儿汗卒，长子沙袭立其位。之后，汗国东西两地又陷入长时间的动荡中。
而阿不都·拉失德汗为了巩固个人的政治统治地位，上台之初，便大肆捕杀宫中的老臣宿将，又竭力削弱都格拉特异密的权力，对外则联盟草原上的月即别——昔班部来对付哈萨克人，并数次将其击败。同时，他还陆续出兵，向西征伐安集延，向东进攻吐鲁番地区，且都取得一定战绩。使得叶尔羌汗国达到了极盛。
在他死后，汗国内部就陷于混乱之中，阿不都·拉失德汗死后，经过一场残酷的宫廷斗争后，二子阿不都·哈林继承汗位。阿不都·哈林汗在位期间，西部地区军事实力不断稳固发展。与此相反，由于从政能力平庸，属众不服，满速儿之子沙汗在东部地区的统治地位则日渐衰微。管理各地事务的家族成员不听调遣，各称雄长。