在王锡爵的两道奏疏一上，自然是立即在朝廷上引起了轩然大波，他们对于王锡爵的这个执政思路自然是极为不满的，现在本身就是朝廷大规模的大计，朝廷上下激烈斗争的时候，而且这次的一个新动向就是浙江官员和南直隶官员的斗争，在这个时候，王锡爵原本是应该低调上任，先安抚这些官员们，使得朝廷的政局先稳定下来，然后再推行自己的各种政策，而不是立即就将自己的观点亮明。
在申时行的府上，新旧两位首辅正在讨论接下来的朝局，申时行对王锡爵说：“元驭啊，此事有些孟浪了！”申时行说的就是王锡爵所上的两本奏疏，在申时行看来，王锡爵的这两本奏疏确实是在朝廷上下引起了极大的震撼，尤其是在科道言官当中，王锡爵本就和这些科道言官关系不好，这下更是使得他们极为不满的，对于王锡爵这个刚刚上任的首辅就心存敌意。
申时行在位的时候，对于这些科道言官还是相对比较和气的，基本上对于这些科道言官还是比较好处理的，在这种情况下，王锡爵一上任就对于科道开火，确实是一个很失策的问题。
对于申时行的劝阻，王锡爵不以为意，他对申时行说道：“瑶泉公，你对科道百般庇护，此辈领情乎？只能以法绳之，昔日严分宜、徐华亭、高新郑、张江陵在时，彼等敢尔！”
对于王锡爵的这个看法，申时行不置可否，王锡爵说的确实是实情，申时行这个首辅，虽然追求的事像李春芳那样和衷共济的想法，但是现在朝廷的现实情况和申时行的个人情况显然是和李春芳有所不同的，从权力上来说，看似两者的权力是差不多的，但是实际上区别是很大的。
李春芳和申时行都是状元首辅，但是李春芳在嘉靖朝就长期担任裕王府讲官，和朱载坖的关系是极为亲密的，深受朱载坖的信任，申时行则是太子讲官出身，虽然也很受朱载坖的信任，但是在这个方面显然是天然不足的，除此之外就是申时行和李春芳的个人势力问题。
李春芳是心学大佬，而申时行是南直隶官员的领袖，看似两人的实力是差不多的，但是实际上是有很大的区别的，李春芳是心学大佬，尤其是在徐阶致
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