官员的选拔、任用、考核、待遇等方面都有一套系统完整的规范，职责划分并不是特别明确的情况下，权力的交叉也是不可避免的，即使内阁在一些强势首辅在位的时候，位高权重，并且能够掌握有人事权，那也不过是皇帝特许或默认的权力而已，并不具有合法性。立法、司法权也一样，内阁无权直接参与，只是通过备顾问或在票拟时对其施加影响而已。
说白了，内阁的所谓权力，都是从皇帝身上来的，内阁能够有多大的权力，主要取决于两点，第一就是阁臣自身的能力和威望，第二点就是皇帝的信任程度，而内阁本身的权力，是并不大的。
内阁大学士不是宰相，是服务于皇帝决策的辅政机构，是一个兼有秘书功能的皇帝的议政咨询机构，而前代的宰相是一个独立的行政机构，无论是从权力还是结构来说，内阁都不能够和前代的宰相、丞相们比的，唐宋政事堂和中书门下就自不待言了，那是可以号令群臣，分理庶务的。
两汉的丞相更是可以开府建牙，征辟僚属的，作为行政中枢，丞相是"掌丞天子助理万机"的最高行政长官，其府署负责全国政务决策与执行，丞相府还有许多其他重要的属官，比如丞相司直、丞相长史、丞相征事、丞相史、丞相少史等等。每个属官都有自己的职责和秩俸，共同协助丞相处理国家政务。
而内阁显然不具备相应的职能和配置，内阁不是一个行政权力机构，是因为它不具有行政职能，也就是行政管理的职责和功能。作为一个行政机构，至少要有组织和管理行政事务的权力。
而所谓行政管理，除了要有行政内容外，还必须具备完整的行政周期，其中至少要有诸如计划、组织、协调、控制等基本职能活动，而这一切在内阁的职掌中都是不存在的。无行政职权，自然不称其为行政权力机构。
在大明，具体行政事务并不是由内阁来负责的，而具体的行政事务的处理，恰恰是六部等衙门的日常政务。内阁只是皇帝与官僚系统之间的桥梁和中介，是一种行政执行权与决策权的间接结合结构。阁权只有通过依附皇权才能实现其政治作用，阁权参预中枢行政
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