倭国虽然结束了南北朝的分裂，但却没有真正意义上的统一，融合。
南朝的军事力量依旧掌握在怀良亲王和成良亲王手上，虽然南朝的后小松天皇已经投降北朝的足利义满，但怀良亲王依旧手握重兵，镇守九州，听调不听宣。
并收降盘踞在壹歧岛上的倭寇三千人，另增兵五千抵御明军。
这个怀良亲王是明朝的死对头，当年胡惟庸欲意谋反，不仅私通陆仲亨，费聚，赵雄等人私下招兵买马，还令明州卫指挥使林贤勾结倭寇，企图借助倭国的力量造反。
倭国的南朝派出刺客如瑶假扮僧人以及四百精锐倭寇交给林贤，准备在进贡之时趁机刺杀洪武爷。
还没等倭国派的人来到大明，胡维庸计划败露，林贤被凌迟处死，这就是发生在明初著名的“林贤通倭案”。
（关于林贤通倭案，疑点颇多，这里不做太多阐述！”
（关于怀良亲王，历史记载不多，有说法他在这个时候当了和尚，有说隐退，还有说已经死了，最多的说法是多次挑衅大明都是别的大名冒用他的名号，这里也不做太多阐述！）