镇总兵王保，当然就是北方人。所以，蓟镇兵变的爆发，就是南北矛盾的爆发，在这次兵变中，缺少支持的南兵被心怀怨恨的北方军官诱杀，随后再扣上个谋反的罪名，这才是事实的真相。
蓟镇之变，其实可以看做是对万历，对明帝国的一个警告。身为九边重镇之首的蓟镇出了这样的事，一定是哪些制度、哪些环节上出了问题，这样继续下去，大明帝国很危险。可惜，万历和群臣选择性忽略了！
自此，抗倭名将戚继光一手创立的戚家军由此而覆灭。
蓟镇之变后，戚继光花费十六年，苦心积虑构筑的防线很快失去了作用。三十多年后，皇太极指挥清军长驱直入，大明的北边各重镇不堪一击。在清军面前，它们仿佛已失去了屏障作用，只剩一道道边墙。
这是万历二十三年，也就是1595年的事情，再过49年，李自成攻陷京都，明朝灭亡。