不许菲军入城的情况下，西班牙把马尼拉“转让”给美国；为照顾西班牙人的面子，由美军发动假进攻。
7月1日，安德逊将军指挥美军由海陆两路向马尼拉市发动总攻，西班牙守军很快投降，美军攻入马尼拉。战争刚一结束，安德逊便撕毁了与起义军达成的协议，以武力逼迫其撤至郊区。
在这场战斗中，美菲军仅伤亡119人，西军伤亡300人。美军缴获武器2.2万件，子弹1000万发，俘虏1.3万。西班牙的腐败可见一斑，宁愿仓库堆在仓库里，上层人享受生活，也不愿拿出来多训练一点军队。
西班牙丢失菲律宾引起了法德两国的不安。法国是西班牙的主要债权国，担心西班牙崩溃会遭受损失，因此希望出面调停。
德国担心美国胜利后称霸太平洋，妨碍自己在远东的扩张，遂派遣舰队前往菲律宾施压。
美国由于亚洲既定的目标已经达成，古巴也没有能力去夺取，另外也迫于国内人民对西班牙舰队在佛罗里达州出现导致的反战情绪日渐高涨，更不愿意与德国关系恶化，因而在占领马尼拉后就同意了接受法国的调停。
1898年8月1日，美西代表在巴黎开始和平谈判。
这场战事，由于少了古巴战事的发生，事件快了整整两个月。西班牙拥有了这样整整四个前无畏舰后，仍无法击败美国，打成这样的局面也是让欧洲大跌眼镜。
西班牙国内倒是歌舞升平，对菲律宾战事的只字不提，对海战美国沉没战舰更多大加宣传。
玛丽亚·克里斯蒂娜没有惩治任何一个人，能够稳定国内的统治，她就十分满足了。那些个贪腐舰队供给的官员，政府都没有去细查。