竟然被自己义子杀死时，不由得长叹了一口气。
然而，就是这一声叹息，却为蔡邕招来了杀身之祸。
蔡邕叹气的时候，王允就在他旁边站着呢。王允勃然大怒，指着蔡邕的鼻子大骂：“董卓是国之罪人，祸国殃民的罪行不可饶恕，你身为天子臣民，应该从大局考虑，从国家出发，共同声讨国贼！你却只是念及他对你的一点私人恩惠，竟然为他感到痛惜，这难道不是与董卓同一鼻孔出气吗？”
王允骂完之后，不容蔡邕分辩，便让士兵将蔡邕押至廷尉处问罪。蔡邕有口难辩，但作为文学家和史官，他为了完成自己的著述，继续写成汉史，便向王允低头，陈辞谢罪，表示愿意承受刺剑削足的酷刑以保全余生。
士大夫们同情蔡邕的遭遇，设法营救，却被王允严词拒绝。估计王允当时正想杀鸡儆猴，震慑董卓的余党吧，否则也不会因为蔡大学士的一声叹息，就蛮不讲理地将蔡邕打进牢狱。
太尉马日磾揣着一张老脸来见王允，说道：“蔡伯喈是难得的旷世奇才，学问渊博，见多识广，特别是对本朝发生的事情了解颇多，我们是否应当给他一个机会，让他继续写成史书。况且，蔡邕以忠孝闻名于士大夫之中，现在以莫须有之名给他判罪，恐怕有失众望，不服人心啊!”
王允根本不听劝告，反驳马日磾说：“先前汉武帝不杀司马迁，让他写成谤书，流传后世，现在国事衰败，社会上缺乏时代精神，不能让蔡邕再像司马迁那样，毁谤和诬蔑幼小的天子，因为这既对神圣的道德教化毫无益处，而且还使我们这些人遭到批评和指责！”
马日磾劝说无果，只得退出王允府邸。
眼看蔡邕就要被赐死的时候，长安城里来了一位身份不起眼的士人，却是幽州刘虞派到长安向蔡家提亲的人到了。