顺义王不他失礼很快就回复朝廷，愿意配合朝廷稳住蒙古诸部的局势，其实三娘子和不他失礼很清楚，朝廷收回活佛继承的权力，对于像顺义王这样的世系蒙古王公来说是很好的，这样可以有效的抑制宗教势力的过度膨胀，使得这些王公们的权力更加稳固，这点他们还是很清楚的，所以他们当即上疏朝廷，表示愿意配合朝廷。
这点朱载坖也是很清楚的，在稳住了蒙古之后，朱载坖的重心就在青藏的这些土司和活佛身上了，尤其是哲蚌寺这样在藏区有很大影响力的寺院，都是朱载坖非常重视的，朱载坖首先以上谕的形式明确了大明和西藏的关系，朱载坖在上谕中明确说道：“番人也是朕之赤子，番人地方都是祖宗开拓的封疆。”
也就是肯定乌斯藏乃是大明的领土这个不容辩驳的事实，对于这点，朱载坖是极为重视的，这点是大明经略乌斯藏的核心，虽然现在大明可以以羁縻的方式承认乌斯藏地方政权的合法性，但是在涉及到朝廷根本利益的问题上，大明是不容挑衅的，这点朱载坖希望乌斯藏的头人、活佛要清楚。
同时朱载坖也明白，乌斯藏的这些活佛和大明皇室的关系其实也是很亲近的，格鲁派创始人宗喀巴大师曾上书成祖皇帝一封书信，在书信中将明朝皇权置于其教权之上，称颂成祖皇帝“政令严明，为各邦所悦服”。他所意指的各邦就是乌斯藏内部各政教势力，显然身居雪域中土的格鲁派也属其中一支，并欣然接受大明管辖。
武宗皇帝还曾经召集了很多的番僧，这些都说明了大明和这些乌斯藏地方势力的关系，同时在经济上的往来也是很重要的，同时朱载坖还和重臣们一道回顾了大明对于乌斯藏的治理方式，其实这个治理方式是从太祖时就确定下来的，就是多封众建，罗万化就说道：“陛下，太祖以西番地广，人犷悍，欲分其势而杀其力，使不为边患，故来者辄授官。”
成祖也继承了太祖皇帝的这个措施并加以调整，成祖主要是建立了僧官制度，诸卫僧戒行精勤者，多授喇嘛、禅师、灌顶国师之号，有加至大国师、西天佛子者，悉给以印诰，许之世袭。可以说现在在乌斯藏有头有脸的
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